Proje Uygulama Dairesi Başkanlığı ve Proje Hazırlama ve İzleme Dairesi Başkanlığı adlarıyla ayrılan birimlerimiz, IPA ÇEVRE olarak, Avrupa Birliği mali iş birliği çerçevesinde çevre, iklim değişikliği ve ilgili alanlarda yürütülen program ve projelerin bütüncül bir yaklaşımla hazırlanması, uygulanması, izlenmesi ve raporlanmasından sorumludur. Bu doğrultuda, proje geliştirme ve programlama faaliyetlerinin yürütülmesi, ihale ve sözleşme süreçlerinin Avrupa Birliği prosedürlerine uygun şekilde koordine edilmesi, finansal yönetim ve raporlamanın sağlanması, kalite güvence ve denetim mekanizmalarının işletilmesi temel görev alanlarını teşkil etmektedir. Her iki daire başkanlığı, ulusal ve uluslararası paydaşlarla iş birliği içerisinde, Avrupa Birliği fonlarının etkin, şeffaf ve sürdürülebilir kullanımını temin etmeyi amaçlamaktadır.